《ハンドレッド》――それは地球を襲う謎の生命体《サベージ》に対抗できる唯一の武器。
主人公如月ハヤトは、そのハンドレッドを用いる《武芸者》を目指すため、海上学園都市艦《リトルガーデン》に入学を果たす。だが――

「会いたかったよ、ハヤトっ!!」
「お、お前は一体……？」

なぜか自分のことをよく知る（?）ルームメイト、エミール・クロスフォードに、どこか懐かしい違和感を覚えるハヤト。
さらに入学早々、学園最強の武芸者《女王》クレア・ハーヴェイから決闘を申し込まれてしまい……!?

箕崎准（ocelot）×大熊猫介（ニトロプラス）がタッグを組んだ、《究極》の学園バトルアクション、ここに開幕！