シスターヘラのありがたい（？）お言葉とともに始まった聖クレス学園の新学期は、最初から波乱含みだった――なにしろエクスター・アイシクルこと朝倉零が、新たに転入生としてやってきたのだ。
予想以上にフレンドリーな学園の生徒達に戸惑いながらも、少しずつ学園に馴染んでいくように見えた零。だが、以前から改造人間を敵視していた彼だけに、その行動にはやっぱり何かウラがあるようで？
一方、夏祭りで由良に「なんでも言うことを聞く」約束をしてしまった一哉は、とうとう由良を大和家につれていき、そのまま同居を開始するハメに。十季子先輩にも事情を説明できないままで、どうなる一哉の新生活!?